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O EthoWatcher® é uma ferramenta computacional disponível gratuitamente para fins não comerciais, desenvolvida por uma equipe de estudantes de pós-graduação trabalhando no Laboratório de Bioengenharia do Instituto de Engenharia Biomédica (IEB-UFSC, Departamento de Engenharia Elétrica, EEL) e no Laboratorio de Neurofisiologia Comparada (Departamento de Ciências fisiológicas) da Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC), para apoiar o uso da etografia (registros por observação direta e sistemática do comportamento), vídeo-tracking, e a extração de variáveis cinemáticas de arquivos de vídeo digitais de animais de laboratório. Seu uso é quase auto-explicativo e você também tem um tutor passo-a-passo built-in disponível o tempo todo.
Se você usou este software, e ele foi útil para a sua pesquisa, pedimos que referencie o artigo que publicamos sobre o programa. Este artigo descreve os procedimentos de validação e calibração do EthoWatcher® em mais detalhes. A citação é:
Crispim Junior CF, Pederiva CN, Bose RC, Garcia VA, Lino-de-Oliveira C, Marino-Neto J. ETHOWATCHER: validation of a tool for behavioral and video-tracking analysis in laboratory animals. Comput Biol Med. 2012; 42(2): 257–64. doi: 10.1016/j.compbiomed.2011.12.002 pmid:22204867.
O desenvolvimento deste software começou informalmente em 2004 como um data-logger comportamental, e rapidamente evoluiu para apoiar uma série de mestrados e doutorados dos desenvolvedores do EthoWatcher ®. Até o momento, este grupo inclui Ricardo Bose, Cesar Pederiva, Vitor Augusto Garcia, Cesar Roberto Pamplona Filho, Marcela Crozara, João Antônio Marcolan, Alex Colussi e (com ênfase especial) Carlos Crispim Jr., que contribuiram em diferentes aspectos do software, sob a supervisão de José Marino Neto (chefe do Laboratório de Bioengenharia, IEB-UFSC). Muitos destes alunos de PG usaram os recursos do EthoWatcher® para investigar algoritmos para análise automatizada e detecção de padrões de comportamento em animais de laboratório baseadas em redes neurais artificiais.
O EthoWatcher tem dois módulos:
O módulo de rastreamento (tracking) permite a segmentação controlada do animal de fundo em um arquivo de vídeo, e entregar automaticamente atributos de imagem que são usados para calcular a distância percorrida, orientação, de comprimento e de área do animal, bem como produzir um registro gráfico do caminho percorrido por ele.
O módulo de etografia permite aos usuários criar e utilizar catálogos comportamentais para gravar eventos comportamentais on-line (do meio ambiente) e off-line (a partir de arquivos de vídeo, de forma contínua ou quadro a quadro), a produção de relatórios sobre a duração, a frequência, latência e a sequência temporal dos comportamentos.
O EthoWatcher tem módulos para etografia (quer diretamente a partir do ambiente, quer de de arquivos de vídeo digital) e para acompanhamento e extração de dados cinemáticos de objetos em movimento nestes arquivos (fotos por Marino).
Estes são Carcarás (Polyborus plancus, Falconiformes) que vivem no nosso telhado e visitam a janela do laboratório regularmente. Mantêm-se a olhar para nós como um etólogo deve fazer para com outros animais. O Sr. e Sra Carcará foram a nossa inspiração para usar o termo “watcher” para este software. (fotos por Marino)
O EthoWatcher® está registrado no Instituto Nacional de Propriedade Intelectual (INPI) sob o protocolo número 09285-3, na revista eletrônica No. 1.982. Este software é distribuído gratuitamente aqui e este é o único local autorizado para fornecer cópias do EthoWatcher. Por favor, leia o contrato de licença de software cuidadosamente antes de usá-lo. Este software é protegido por direitos autorais de acordo com as disposições para a proteção dos programas de computador. Estas disposições incluem, em particular, o código do programa, a documentação, a aparência, a estrutura e organização dos arquivos do programa, o nome do programa, logotipos e outras formas de apresentação dentro do software. Todos os outros direitos decorrentes de direitos de autor pertencem à entidade licenciadora (UFSC). Aviso: A reprodução, modificação ou distribuição não autorizadas deste programa pode resultar em sanções penais.
Outras ferramentas importantes para neurobiólogos comportamentais
Há uma variedade de sistemas de registro e análise comportamental disponível (alguns deles também são distribuídos gratuitamente). Vemos os recursos EthoWatcher como apenas complementares ou como alternativas a estes programas. Gostaríamos de recomendar uma visita aos sites abaixo antes de iniciar seu projeto, para descobrir os recursos que melhor se encaixam às suas necessidades.
Behavioral Phenotyping
Biobserve – Viewer
JWatcher
LABORAS
SOCPROG :
NoldusEthoVison
Tracksys Ltd
Virtual dub –
A lista é (felizmente) mais longa. Vou tentar mantê-la atualizada e em crescimento. Se você conhece alguma outra ferramenta interessante para a etografia, por favor avise-nos e ficaremos felizes por adicioná-la aqui.
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